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1.
Biochimie ; 171-172: 23-30, 2020.
Article in English | MEDLINE | ID: mdl-32014504

ABSTRACT

Bacterial ADP-glucose pyrophosphorylases are allosterically regulated by metabolites that are key intermediates of central pathways in the respective microorganism. Pyruvate (Pyr) and fructose 6-phosphate (Fru6P) activate the enzyme from Agrobacterium tumefaciens by increasing Vmax about 10- and 20-fold, respectively. Here, we studied the combined effect of both metabolites on the enzyme activation. Our results support a model in which there is a synergistic binding of these two activators to two distinct sites and that each activator leads the enzyme to distinct active forms with different properties. In presence of both activators, Pyr had a catalytically dominant effect over Fru6P determining the active conformational state. By mutagenesis we obtained enzyme variants still sensitive to Pyr activation, but in which the allosteric signal by Fru6P was disrupted. This indicated that the activation mechanism for each effector was not the same. The ability for this enzyme to have more than one allosteric activator site, active forms, and allosteric signaling mechanisms is critical to expand the evolvability of its regulation. These synergistic interactions between allosteric activators may represent a feature in other allosteric enzymes.


Subject(s)
Agrobacterium tumefaciens/enzymology , Bacterial Proteins/metabolism , Fructosephosphates/metabolism , Glucose-1-Phosphate Adenylyltransferase/metabolism , Pyruvic Acid/metabolism , Allosteric Regulation , Allosteric Site , Enzyme Activation , Kinetics , Models, Molecular
2.
Biochimie ; 93(10): 1816-23, 2011 Oct.
Article in English | MEDLINE | ID: mdl-21741429

ABSTRACT

ADP-glucose pyrophosphorylase is the enzyme responsible for the regulation of glycogen synthesis in bacteria. The enzyme N-terminal domain has a Rossmann-like fold with three neighbor loops facing the substrate ATP. In the Escherichia coli enzyme, one of those loops also faces the regulatory site containing Lys(39), a residue involved in binding of the allosteric activator fructose-1,6-bisphosphate and its analog pyridoxal-phosphate. The other two loops contain Trp(113) and Gln(74), respectively, which are highly conserved among all the ADP-glucose pyrophosphorylases. Molecular modeling of the E. coli enzyme showed that binding of ATP correlates with conformational changes of the latter two loops, going from an open to a closed (substrate-bound) form. Alanine mutants of Trp(113) or Gln(74) did not change apparent affinities for the substrates, but they became insensitive to activation by fructose-1,6-bisphosphate. By capillary electrophoresis we found that the mutant enzymes still bind fructose-1,6-bisphosphate, with similar affinity as the wild type enzyme. Since the mutations did not alter binding of the activator, they must have disrupted the communication between the regulatory and the substrate sites. This agrees with a regulatory mechanism where the interaction with the allosteric activator triggers conformational changes at the level of loops containing residues Trp(113) and Gln(74).


Subject(s)
Escherichia coli/enzymology , Fructosediphosphates/metabolism , Glucose-1-Phosphate Adenylyltransferase/chemistry , Glucose-1-Phosphate Adenylyltransferase/metabolism , Allosteric Regulation , Electrophoresis, Capillary , Glucose-1-Phosphate Adenylyltransferase/genetics , Models, Molecular , Mutagenesis, Site-Directed
3.
Medicina (B.Aires) ; 59(6): 693-7, 1999.
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-253523

ABSTRACT

Los marcadores serológicos comúnmente utilizados en el diagnóstico de la enfermedad celíaca son los anticuerpos antigliadina (AG) y antiendomisio (AE). Recientemente (1997) se identificó a la transglutaminasa de tejido (tTG) como el principal autoantígeno de los anticuerpos AE. El objetivo de este trabajo fue determinar la sensibilidad y especificidad de testes de ELISA desarrollados en base a la utilización de estructuras moleculares definidas como antígenos de captura para los anticuerpos AG y AE. Como antígenos inmovilizados para los anticuerpos AG se ensayaron tres péptidos de sínteses correspondientes a la región amino terminal de la alfa gliadina y para los AE, la transglutaminasa de hígado de cobayo. Se examinaron un total de 80 sueros correspondientes a: pacientes celíacos, no tratados y tratados, controles enfermos no celíacos y controles sanos. Rango de edad: 7 meses a 14 años. Se obtuvo una sensibilidad del 97 por ciento y una especificidad 86 por ciento para la IgG determinada utilizando como antígeno uno de los tres péptidos de síntesis (correspondiente a los residuos 31-55 de la alfa gliadina). Este péptido aparece como un antígeno altamente sensible y más específico que la gliadina. El mejor resultado, con un 100 por ciento de especificidad y sensibilidad, se obtuvo en la determinación de la IgA anti-tTG, lo que destaca la relevancia de estos anticuerpos como marcadores serológicos de la enfermedad celíaca.


Subject(s)
Child, Preschool , Child , Infant , Adolescent , Humans , Male , Female , Antibodies/blood , Antigens/blood , Celiac Disease/diagnosis , Gliadin/immunology , Peptides/immunology , Transglutaminases/immunology , Biomarkers , Celiac Disease/enzymology , Enzyme-Linked Immunosorbent Assay , Gliadin/biosynthesis , Immunoglobulin A/blood , Immunoglobulin G/blood , Sensitivity and Specificity , Serologic Tests
4.
Medicina [B.Aires] ; 59(6): 693-7, 1999.
Article in Spanish | BINACIS | ID: bin-13663

ABSTRACT

Los marcadores serológicos comúnmente utilizados en el diagnóstico de la enfermedad celíaca son los anticuerpos antigliadina (AG) y antiendomisio (AE). Recientemente (1997) se identificó a la transglutaminasa de tejido (tTG) como el principal autoantígeno de los anticuerpos AE. El objetivo de este trabajo fue determinar la sensibilidad y especificidad de testes de ELISA desarrollados en base a la utilización de estructuras moleculares definidas como antígenos de captura para los anticuerpos AG y AE. Como antígenos inmovilizados para los anticuerpos AG se ensayaron tres péptidos de sínteses correspondientes a la región amino terminal de la alfa gliadina y para los AE, la transglutaminasa de hígado de cobayo. Se examinaron un total de 80 sueros correspondientes a: pacientes celíacos, no tratados y tratados, controles enfermos no celíacos y controles sanos. Rango de edad: 7 meses a 14 años. Se obtuvo una sensibilidad del 97 por ciento y una especificidad 86 por ciento para la IgG determinada utilizando como antígeno uno de los tres péptidos de síntesis (correspondiente a los residuos 31-55 de la alfa gliadina). Este péptido aparece como un antígeno altamente sensible y más específico que la gliadina. El mejor resultado, con un 100 por ciento de especificidad y sensibilidad, se obtuvo en la determinación de la IgA anti-tTG, lo que destaca la relevancia de estos anticuerpos como marcadores serológicos de la enfermedad celíaca. (AU)


Subject(s)
Child, Preschool , Child , Infant , Adolescent , Humans , Male , Female , Celiac Disease/diagnosis , Transglutaminases/immunology , Antibodies/blood , Gliadin/immunology , Antigens/blood , Peptides/immunology , Biomarkers , Sensitivity and Specificity , Enzyme-Linked Immunosorbent Assay , Immunoglobulin A/blood , Immunoglobulin G/blood , Gliadin/biosynthesis , Serologic Tests , Celiac Disease/enzymology
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